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- Por Emanuel Rodríguez
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Una de las herramientas más desarrolladas de 3D Slicer es la dirigida a realizar reconstrucciones volumétricas con base en conjuntos de imágenes en los tres distintos planos: axial, coronal y sagital. Para explicar esta herramienta utilizaremos datos de muestra que pueden ser descargados desde el sitio oficial de Slicer.
Una vez descargados, abriremos el archivo de interés. Para esto hacemos clic en Add data.
Elegimos importar desde carpeta y la abrimos.
Marcamos únicamente el archivo MRML Scene y clic en Ok.
Podemos visualizar entonces una reconstrucción en 3D y los cortes en axial, sagital y coronal.
En la herramienta "Vista", vamos a seleccionar "Conventional Widescreen".
De forma que se observe similar a el ejemplo.
En la ventana de cortes axiales podemos activar su superposición con la reconstrucción en 3D haciendo clic en el pin de la esquina y luego en el ojo.
Utilizando la herramienta Models podemos ver a la izquierda todos los elementos identificados dentro de las imágenes con sus respectos colores de representación. Nota: en un futuro artículo explicaré como crear estos modelos.
Para editar alguno de ellos hacemos clic sobre él y nos dirigimos a la pestaña Display. En ella, podremos modificar color, opacidad, luminosidad, tipo de textura y editar muchos parámetros más relacionados al volumen.
El resultado de editar la opacidad en piel es este.
Si bajamos la opacidad a piel y cráneo y activamos la opción de visualización de los cortes en axial y coronal en vista 3D el resultado será así.
O así.
Pero ¿cómo creamos una reconstrucción en 3D a partir de imágenes 2D?
Una vez que tengamos importadas imágenes en los tres planos podremos crear una reconstrucción en 3D por medio del módulo Volume Rendering.
Elegimos el conjunto de imágenes y hacemos clic en el ojo de la izquierda.
Podemos elegir alguno de los mapas de colores predeterminados.
O definir parámetros a nuestro gusto en la pestaña "Advanced".
Para un resultado como este.
Esta herramienta, como hemos visto, ofrece muchas posibilidades para post procesamiento de imágenes. La calidad de una reconstrucción varía de acuerdo a la calidad de las imágenes originales. En futuros artículos estaré profundizando en más herramientas que implican la reconstrucción volumétrica y que combinadas con otras pueden llegar a ser muy útiles en distintas situaciones.