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Domingo, 01 Diciembre 2013 03:36

Reconstrucciones volumétricas con 3D Slicer.

Una de las herramientas más desarrolladas de 3D Slicer es la dirigida a realizar reconstrucciones volumétricas con base en conjuntos de imágenes en los tres distintos planos: axial, coronal y sagital. Para explicar esta herramienta utilizaremos datos de muestra que pueden ser descargados desde el sitio oficial de Slicer. Una vez descargados, abriremos el archivo de interés. Para esto hacemos clic en Add data. Elegimos importar desde carpeta y la abrimos. Marcamos únicamente el archivo MRML Scene y clic en Ok. Podemos visualizar entonces una reconstrucción en 3D y los cortes en axial, sagital y coronal. En la herramienta "Vista",…
Sábado, 30 Noviembre 2013 18:00

Introducción a 3D Slicer

Slicer o 3D Slicer es un paquete informático gratuito y de código abierto para visualización, análisis y procesado de imágenes médicas. Está disponible para las plataformas Windows, Mac OS X y Linux. La versión 4.3 fue liberada en setiembre de 2013. Slicer cuenta con una comunidad que da soporte y desarrollo al programa. Slicer cuenta con un sinfín de posibilidades en post-procesamiento de imágenes médicas. Con capacidades DICOM muy robustas, renderización volumétrica, vistas configurables, capturas de pantalla de imágenes post-procesadas, visualización de imágenes en 4D y una base de datos de extensiones en áreas como Resonancia Magnética, Medicina Nuclear, Radioterapia…
Amide es una herramienta gratuita de visualización, análisis y registro de conjuntos de imágenes volumétricas de grado médico. Actualmente disponible para plataformas Windows, Mac OS X y Linux este software es una excelente opción para la manipulación, edición y representación volumétrica de muchas modalidades de imagen entre ellas TC, PET y RMN. Es una excelente herramienta para realizar reconstrucciones con base en cortes en distintos planos, dibujar contornos (incluso volumétricos), post-procesamiento usual de imágenes médicas y gestión de estudios multi-modalidad. Es decir, permite superponer imágenes de un tipo (ej. TC) con imágenes de otro (ej. PET). Se rige bajo estándares…
Dicompyler es una versátil plataforma de investigación en radioterapia bajo licencia BSD 3-Clause basada en estándares DICOM. A su vez, funciona como visor de contenido DICOM. Es compatible con las plataformas Linux, Windows y Mac OS X; aclaro que todos los procesos de prueba que se verán en este artículo se realizaron bajo la plataforma Linux (Kernel 3.2.0-56-generic). Aunque es desarrollado desde hace ya algunos años (2010), se dio a conocer al ser seleccionado como parte de las herramientas que utiliza el "National Radiation Oncology Registry" (NROR) estadounidense en investigación. Dicompyler permite importar imágenes de Tomografía Computarizada, Resonancia Magnética y…